Когда мы заселялись, у нас тоже была такая проблема. Причин может быть несколько.
1. Если у соседей сверху стандартные раздвижные окна на лоджии и они оставили их открытыми. Был ливень или снегопад.
2. Большая щель в соединения плит с верхним этажом в аппендиците. Видно визуально, если выглянуть в окно. У меня текла вода когда был снег или дождь с сильным боковым ветром. Снег набивался в щель, потом таял и протекал во внутрь.
Запенил эту щель и проблема исчезла.
3. Подтекал угол оконного блока и аппендикса. Просто щели были. Так как мы меняли окна на лоджии, проблему решили при их установке.